科技小巨人工程采取市區(qū)(縣)聯(lián)動方式,實行市區(qū)(縣)科技行政管理部門集中受理,市區(qū)(縣)科技和產業(yè)行政管理部門聯(lián)合評審、共同授牌的方式。
科技小巨人企業(yè)申報條件包括以下幾個方面：
企業(yè)需要擁有自主知識產權，包括發(fā)明專利、實用新型專利、外觀設計專利、軟件著作權等。這些知識產權需要與企業(yè)主要產品（服務）在技術上發(fā)揮核心支持作用。
企業(yè)近三個會計年度的研究開發(fā)費用總額占同期營業(yè)收入總額的比例需要不低于4%，其中軟件和信息技術服務業(yè)、醫(yī)藥制造業(yè)的比例不低于6%。
企業(yè)上一年度從事研發(fā)和相關技術創(chuàng)新活動的科技人員占企業(yè)職工總數(shù)的比例不低于10%且達50人（含）以上。
企業(yè)上一年度主導高新技術產品（服務）收入占企業(yè)同期總收入的比例不低于60%，市場占有率位于全省前3位或全國前5位。
企業(yè)上一年度營業(yè)收入需要達到2億元（含）以上。
近三個會計年度營業(yè)收入或凈利潤復合增長率達15%以上，或近三個會計年度累計獲得股權融資超過8000萬元（或等值外幣）。
申請前一年企業(yè)未發(fā)生重大安全、重大質量事故或嚴重環(huán)境違法行為。山區(qū)26縣、海島縣企業(yè)，可適當放寬營業(yè)收入或市場占有率等部分條件要求。
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